Próximamente compartiremos aquí información detallada sobre los contenidos específicos que abordaremos en los talleres y cursos de MacroData. Estamos trabajando en definir los temas, herramientas y metodologías que mejor respondan a los objetivos del proyecto. Por el momento, esto es lo que tenemos pensado:
Fundamentos de programación en R
- Introducción a R y un IDE.
- Tipos de datos, estructuras básicas, funciones y control de flujo.
- Manipulación de datos con
base
R ytidyverse
breve. - Visualización con
ggplot2
.
Ciencia de datos para biología
- Importación, limpieza y organización de datos.
- Exploración y análisis estadístico básico.
- Principios de reproducibilidad: proyectos, scripts y documentación.
- Introducción al uso de Git y GitHub en proyectos colaborativos.
Filogenias y macroevolución
- ¿Qué es una filogenia? ¿Cómo se interpreta?
- Reconstrucción filogenética con datos moleculares.
- Uso del paquete phruta para filogenias automatizadas.
- Calibración temporal.
Métodos comparativos filogenéticos
- Análisis de rasgos continuos y discretos en contextos filogenéticos.
- Modelos de evolución de caracteres.
- Identificación de correlaciones evolutivas y patrones macroevolutivos.
- Uso de herramientas como
ape
,geiger
,phytools
.
Ciencia abierta y colaboración
- Documentación y licencias para proyectos científicos abiertos.
- Prácticas de citación y ética en el trabajo colaborativo.
- Herramientas para compartir datos, scripts y resultados.
Proyecto final
- Aplicación de lo aprendido en un análisis real.
- Discusión y escritura colectiva de un manuscrito científico.